Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRAMD4Q6IC98 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRAMD4Q6IC98 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms