Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF123Q5XPI4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms