Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms