Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf60Q5U649 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms