Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC3LQ5T215 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms