Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH8Q5T0T0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms