Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP78Q5JTW2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP78Q5JTW2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms