Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR44Q5JSH3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR44Q5JSH3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms