Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR3Q5GH77 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms