Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms