Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP55Q53EZ4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms