Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC153Q494R4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms