Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms