Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-4Q3LI77 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms