Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD55Q3KP44 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD55Q3KP44 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms