Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GEN1Q17RS7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GEN1Q17RS7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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