Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CLPPQ16740 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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