Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPE65Q16518 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPE65Q16518 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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