Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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TNXAQ16473 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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TNXAQ16473 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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TNXAQ16473 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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TNXAQ16473 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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TNXAQ16473 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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TNXAQ16473 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNXAQ16473 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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