Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD8Q15843 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NEDD8Q15843 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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