Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIP4Q15650 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIP4Q15650 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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