Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIX1Q15475 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIX1Q15475 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX1Q15475 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX1Q15475 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIX1Q15475 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIX1Q15475 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SIX1Q15475 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIX1Q15475 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIX1Q15475 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SIX1Q15475 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIX1Q15475 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIX1Q15475 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIX1Q15475 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX1Q15475 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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