Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABEP1Q15276 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABEP1Q15276 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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