Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRKQ15262 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRKQ15262 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
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