Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCLAFQ15004 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCLAFQ15004 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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