Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALCAMQ13740 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
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