Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
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PTCH1Q13635 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
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PTCH1Q13635 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
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PTCH1Q13635 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
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PTCH1Q13635 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
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PTCH1Q13635 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCH1Q13635 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
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