Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUL4AQ13619 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUL4AQ13619 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms