Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BFSP2Q13515 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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