Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MSLNQ13421 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MSLNQ13421 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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