Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGCGQ13326 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCGQ13326 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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