Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NME3Q13232 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NME3Q13232 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NME3Q13232 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NME3Q13232 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME3Q13232 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME3Q13232 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NME3Q13232 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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