Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPA4Q13156 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPA4Q13156 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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