Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHAF1AQ13111 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHAF1AQ13111 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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