Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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FOXC1Q12948 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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FOXC1Q12948 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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FOXC1Q12948 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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FOXC1Q12948 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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FOXC1Q12948 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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FOXC1Q12948 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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FOXC1Q12948 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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FOXC1Q12948 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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FOXC1Q12948 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXC1Q12948 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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