Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFIAQ12857 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIAQ12857 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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