Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 IRC4YDR540C 540 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 YGR283CYGR283C 1026 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 YOL014WYOL014W 375 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 PNT1YOR266W 1272 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 TYE7YOR344C 876 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 FBP26YJL155C 1359 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 RPL34BYIL052C 366 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 PET130YJL023C 1044 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 YNL109WYNL109W 546 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 YCL046WYCL046W 324 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 TRM82YDR165W 1335 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 RKM4YDR257C 1485 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 YOR019WYOR019W 2193 nt1.28□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 EAP1YKL204W 1899 nt1.28□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 ISA2YPR067W 558 nt1.28□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 YSY6YBR162W-A 198 nt1.28□□□□□ -2.2
TY1B-BLQ12490 SMT3YDR510W 306 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 UTP30YKR060W 825 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 VMA6YLR447C 1038 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 RPS17AYML024W 411 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 PEP12YOR036W 867 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 HNT3YOR258W 654 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 PMD1YER132C 5262 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 UTP8YGR128C 2142 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 SLY41YOR307C 1362 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YCL068CYCL068C 783 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YCR007CYCR007C 720 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 RVS161YCR009C 798 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 WIP1YDR374W-A 270 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 RDN58-1RDN58-1 158 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 RDN58-2RDN58-2 158 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 COS1YNL336W 1146 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 SYO1YDL063C 1863 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 URA5YML106W 681 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YNL043CYNL043C 321 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 HUB1YNR032C-A 222 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 AIM11YER093C-A 414 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YMR320WYMR320W 306 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YPR146CYPR146C 330 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YBR292CYBR292C 372 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 DXO1YDR370C 1329 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YPR148CYPR148C 1308 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 NCE101YJL205C 162 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 RTT101YJL047C 2529 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 MPO1YGL010W 525 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YGL165CYGL165C 579 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 LSM2YBL026W 288 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YNL184CYNL184C 327 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 THI80YOR143C 960 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 USV1YPL230W 1176 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YDR521WYDR521W 336 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YKL162CYKL162C 1209 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 AAH1YNL141W 1044 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 ECM18YDR125C 1362 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 PIN4YBL051C 2007 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-BLQ12490 YCL076WYCL076W 744 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 SKO1YNL167C 1944 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 CDC37YDR168W 1521 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 PAU8YAL068C 363 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 YBL029WYBL029W 1131 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 PAU20YOL161C 363 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 SFG1YOR315W 1041 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 RUD3YOR216C 1455 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 SEC21YNL287W 2808 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 COS7YDL248W 1152 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 PCL6YER059W 1263 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 RPL11BYGR085C 525 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 RPL11AYPR102C 525 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 YBR096WYBR096W 693 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 VAM6YDL077C 3150 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 BUL2YML111W 2763 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 DPP1YDR284C 870 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 CLC1YGR167W 702 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 UBC7YMR022W 498 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 CMC4YMR194C-B 222 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 SHE3YBR130C 1278 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 GYL1YMR192W 2163 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 AI2Q0055 2565 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 SEC59YMR013C 1560 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 YGR026WYGR026W 837 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 TFA2YKR062W 987 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 YML084WYML084W 309 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 NME1NME1 340 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 YOR218CYOR218C 420 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-BLQ12490 HSH49YOR319W 642 nt1.19□□□□□ -2.22
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