Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SYCNQ0VAF6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SYCNQ0VAF6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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