Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD47Q08722 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD47Q08722 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD47Q08722 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CD47Q08722 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD47Q08722 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD47Q08722 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD47Q08722 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD47Q08722 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD47Q08722 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD47Q08722 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD47Q08722 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD47Q08722 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD47Q08722 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD47Q08722 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms