Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4DQ08499 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4DQ08499 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms