Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC18A2Q05940 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A2Q05940 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms