Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL6Q02878 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms