Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APBA1Q02410 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms