Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHDQ02161 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHDQ02161 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHDQ02161 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHDQ02161 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHDQ02161 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHDQ02161 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHDQ02161 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHDQ02161 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHDQ02161 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHDQ02161 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHDQ02161 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHDQ02161 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHDQ02161 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms