Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BNC1Q01954 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms