Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD4Q01804 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD4Q01804 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD4Q01804 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTUD4Q01804 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms