Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXK2Q01167 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXK2Q01167 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms