Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNB1P98172 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms