Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR1P84550 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms