Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTA1P68133 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTA1P68133 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms